More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2854 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  100 
 
 
388 aa  784    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  51.55 
 
 
384 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  50.41 
 
 
384 aa  358  9e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  48.84 
 
 
383 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  46.25 
 
 
374 aa  324  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  37.41 
 
 
393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.06 
 
 
393 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.29 
 
 
393 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.34 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  33.83 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  35.76 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
405 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.26 
 
 
400 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.81 
 
 
400 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.16 
 
 
400 aa  202  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  35.26 
 
 
401 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  37.31 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  34.39 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
396 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.63 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  34.14 
 
 
403 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  37.31 
 
 
400 aa  189  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  35.23 
 
 
374 aa  186  8e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.53 
 
 
397 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  32.93 
 
 
397 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 
392 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
411 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  33.54 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  30.65 
 
 
393 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  33.84 
 
 
414 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
411 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
393 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
391 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.89 
 
 
439 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  31.95 
 
 
393 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  30.73 
 
 
387 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  32.12 
 
 
391 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.66 
 
 
393 aa  156  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
403 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.02 
 
 
376 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.86 
 
 
357 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.24 
 
 
355 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.24 
 
 
355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.81 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.77 
 
 
359 aa  133  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
854 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.94 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  28.35 
 
 
361 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  30.75 
 
 
370 aa  123  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  28.57 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.12 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.17 
 
 
357 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.17 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  29.12 
 
 
361 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
810 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  29.24 
 
 
361 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.44 
 
 
357 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.74 
 
 
351 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  28.7 
 
 
364 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.53 
 
 
357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.15 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  27.72 
 
 
816 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  26.11 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  35.04 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  26.36 
 
 
832 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  25.99 
 
 
833 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  26.28 
 
 
828 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  28.9 
 
 
325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  29.28 
 
 
387 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  27.38 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.87 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
830 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 
325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.49 
 
 
354 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.49 
 
 
355 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 
387 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.04 
 
 
365 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.43 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.59 
 
 
843 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.48 
 
 
247 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
841 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  29.52 
 
 
821 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  32.63 
 
 
253 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  27.91 
 
 
843 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0205  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.11 
 
 
458 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0985366  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  29.38 
 
 
330 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  27.64 
 
 
818 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.51 
 
 
344 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  28.28 
 
 
392 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  28.25 
 
 
820 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  29.15 
 
 
329 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  28.24 
 
 
325 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  25.92 
 
 
776 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>