More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5109 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  80.92 
 
 
393 aa  650    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
393 aa  773    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  79.9 
 
 
393 aa  628  1e-179  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  66.67 
 
 
393 aa  521  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  66.16 
 
 
439 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  57.46 
 
 
402 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  55.47 
 
 
402 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.96 
 
 
397 aa  333  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  43.54 
 
 
396 aa  329  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.43 
 
 
400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  40.3 
 
 
414 aa  305  6e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  44.53 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  41.48 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  43.91 
 
 
400 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  44.27 
 
 
399 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  43.48 
 
 
403 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  37.44 
 
 
411 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  38.42 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  39.43 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  37.94 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  37 
 
 
411 aa  281  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  37.19 
 
 
411 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  36.83 
 
 
401 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
400 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  39.59 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  38.13 
 
 
404 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.66 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  35.88 
 
 
374 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.15 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  35.26 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  35.08 
 
 
393 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.77 
 
 
393 aa  195  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.78 
 
 
405 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  33.96 
 
 
384 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
397 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.07 
 
 
383 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  36.09 
 
 
391 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.13 
 
 
374 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 
349 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  39.01 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  31.95 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.04 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.99 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.25 
 
 
392 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.54 
 
 
354 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  32.06 
 
 
387 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.38 
 
 
357 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.22 
 
 
358 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.32 
 
 
392 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.91 
 
 
349 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.94 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  30.75 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3642  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  33.5 
 
 
454 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0848816  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  29.62 
 
 
325 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.15 
 
 
355 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  26.7 
 
 
385 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
355 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.14 
 
 
355 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3873  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.8 
 
 
454 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.24 
 
 
355 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.51 
 
 
354 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  39.91 
 
 
248 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.94 
 
 
351 aa  150  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  30.72 
 
 
325 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.35 
 
 
355 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.71 
 
 
358 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  40.18 
 
 
247 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.61 
 
 
359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4605  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.86 
 
 
452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.06 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 
344 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73220  glucosamine-1-phosphate acetyltransferase/N-acetyl  30.36 
 
 
454 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4237  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.85 
 
 
454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.016963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4484  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.28 
 
 
455 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150295  hitchhiker  0.0000109474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6354  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  30.13 
 
 
454 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.25 
 
 
376 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.33 
 
 
355 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3954  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.98 
 
 
454 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000397329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.38 
 
 
355 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  38.79 
 
 
245 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0099  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.3 
 
 
456 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.749054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.38 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.39 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.23 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4043  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.57 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.394972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4745  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.26 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 
355 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18871  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.82 
 
 
470 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4895  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.13 
 
 
454 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.508264  normal  0.342908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3842  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.35 
 
 
454 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.219458  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  36.86 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4197  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.24 
 
 
456 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.55 
 
 
355 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.72 
 
 
355 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4363  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.82 
 
 
460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0199038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4228  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.6 
 
 
456 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4174  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.6 
 
 
456 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.92756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4200  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.6 
 
 
458 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.236226  normal  0.243995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>