More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2229 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 399 aa  816    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  65.91 
 
 		 400 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  61.15 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  61.46 
 
 		 401 aa  513  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  63.41 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  49.37 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  49.37 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  48.12 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  48.48 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  48.61 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  43.97 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  43.92 
 
 		 400 aa  340  4e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  41.39 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  42.64 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  41.22 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  42.01 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  41.62 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  39.75 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  41.48 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  41.56 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  39.6 
 
 		 411 aa  288  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  39.61 
 
 		 414 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  37.53 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.79 
 
 		 405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.53 
 
 		 393 aa  258  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  37.62 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  36.27 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.14 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  37.01 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  34.92 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  38.15 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  33.17 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.94 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.72 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.72 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.81 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  31.13 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  30.79 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.94 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.63 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.39 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  29.93 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 		 816 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  32.3 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.94 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.7 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.18 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  28.92 
 
 		 820 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  34.12 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.13 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.73 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.75 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  31.02 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  32.58 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.36 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.03 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.88 
 
 		 224 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  28.25 
 
 		 818 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 830 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  32.85 
 
 		 840 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  30.15 
 
 		 828 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.83 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.84 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.23 
 
 		 358 aa  156  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.14 
 
 		 828 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.76 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  29.17 
 
 		 827 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.71 
 
 		 810 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  31.78 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.18 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.45 
 
 		 355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  35 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.01 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.53 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.45 
 
 		 828 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.03 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.3 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.65 
 
 		 784 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.75 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2629  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.52 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.65 
 
 		 784 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.6 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 784 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.27 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.89 
 
 		 784 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  30.27 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>