More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2166 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
387 aa  761    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  63.92 
 
 
392 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  47.31 
 
 
397 aa  350  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  48.07 
 
 
397 aa  342  8e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  38.21 
 
 
391 aa  222  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  36.5 
 
 
391 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  32.57 
 
 
405 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.53 
 
 
405 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 
384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.42 
 
 
383 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
400 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  32.59 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.34 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.5 
 
 
400 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  33.25 
 
 
403 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.23 
 
 
414 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  28.93 
 
 
399 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
393 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.48 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  30.37 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.08 
 
 
393 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.98 
 
 
397 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  29.14 
 
 
411 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.51 
 
 
393 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 
401 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
411 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 
399 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.73 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.56 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  34 
 
 
439 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
384 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
402 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
393 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
374 aa  159  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
399 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  31.73 
 
 
393 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  32.83 
 
 
402 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.77 
 
 
385 aa  154  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.51 
 
 
349 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  32.06 
 
 
393 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  33.01 
 
 
818 aa  149  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.34 
 
 
357 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
820 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.6 
 
 
357 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  29.92 
 
 
832 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  29.74 
 
 
835 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.41 
 
 
827 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  31.7 
 
 
828 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.53 
 
 
828 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  29.38 
 
 
842 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.92 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.45 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  31.07 
 
 
841 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.09 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
776 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  28.79 
 
 
830 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
349 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  26.42 
 
 
392 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.74 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  36.32 
 
 
248 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
830 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  27.99 
 
 
828 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
841 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  31.11 
 
 
843 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  29.74 
 
 
827 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  29.13 
 
 
833 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  29.59 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
821 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 
370 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  31.15 
 
 
810 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 
854 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  26.22 
 
 
828 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.79 
 
 
355 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  28.68 
 
 
834 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.49 
 
 
355 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
358 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
370 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  27.24 
 
 
387 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
245 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.46 
 
 
355 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  28.46 
 
 
816 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.01 
 
 
363 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
247 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  30.15 
 
 
366 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.79 
 
 
325 aa  123  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  26.82 
 
 
387 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
257 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  30.72 
 
 
325 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  27.75 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  28.5 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  28.39 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  28.05 
 
 
820 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  27.96 
 
 
843 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.83 
 
 
359 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
832 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  28.09 
 
 
785 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>