More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5901 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  89.61 
 
 
358 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
356 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  74.86 
 
 
355 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  66.2 
 
 
355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  66.57 
 
 
355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  63.84 
 
 
355 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.72 
 
 
358 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.32 
 
 
355 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.04 
 
 
355 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.38 
 
 
355 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.9 
 
 
355 aa  385  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
357 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.27 
 
 
355 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.12 
 
 
357 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.69 
 
 
354 aa  363  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.81 
 
 
357 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.41 
 
 
364 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.53 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  50.98 
 
 
358 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.97 
 
 
356 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
357 aa  352  8e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.47 
 
 
376 aa  348  6e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 
357 aa  342  7e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.7 
 
 
355 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 
357 aa  338  7e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.32 
 
 
355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
355 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
359 aa  332  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.61 
 
 
355 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.73 
 
 
353 aa  322  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.22 
 
 
357 aa  315  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.09 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 
354 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.68 
 
 
358 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.18 
 
 
344 aa  293  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 
355 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.02 
 
 
354 aa  275  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.87 
 
 
351 aa  267  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.08 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.65 
 
 
397 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.46 
 
 
365 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.43 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.39 
 
 
400 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.61 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.25 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
302 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.05 
 
 
298 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  33.83 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.21 
 
 
400 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.95 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  33.53 
 
 
411 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
294 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
296 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
300 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
291 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
296 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
294 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.5 
 
 
289 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.42 
 
 
292 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
301 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.4 
 
 
293 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.24 
 
 
296 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.34 
 
 
292 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  38.66 
 
 
289 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.3 
 
 
296 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
293 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
296 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.76 
 
 
312 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0436  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
287 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0446  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
287 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  37.13 
 
 
253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.41 
 
 
293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.48 
 
 
293 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
292 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
297 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
296 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1570  dTDP-glucose pyrophosphorylase  39.17 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.84 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0285  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00700603  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3308  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.67 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242939  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.27 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>