More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 		 300 aa  617  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2049  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  75.92 
 
 		 300 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1570  dTDP-glucose pyrophosphorylase  75.34 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  70.33 
 
 		 300 aa  443  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1135  dTDP-glucose pyrophosphorylase  71.33 
 
 		 294 aa  441  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.12196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.67 
 
 		 294 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  69.97 
 
 		 292 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.33 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 		 289 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.64 
 
 		 298 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.87 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.93 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.47 
 
 		 292 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 		 289 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  65.62 
 
 		 289 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.55 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.01 
 
 		 297 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 292 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.29 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.44 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.7 
 
 		 297 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 297 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.01 
 
 		 292 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.1 
 
 		 293 aa  387  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.4 
 
 		 294 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.25 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 295 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.74 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  64.6 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.44 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.74 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  64.6 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.33 
 
 		 297 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 297 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.52 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.55 
 
 		 296 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.29 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.14 
 
 		 291 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.74 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.52 
 
 		 289 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.75 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.99 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.33 
 
 		 297 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.14 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  63.41 
 
 		 292 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.93 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.73 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  70.52 
 
 		 270 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 297 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.01 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 		 293 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.64 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.86 
 
 		 287 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3801  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.11 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.16 
 
 		 294 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.09 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.07 
 
 		 293 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.01 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.56 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.48 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 		 286 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.1 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.81 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  64.48 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 312 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.18 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.05 
 
 		 292 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.2 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.14 
 
 		 292 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.11 
 
 		 287 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 292 aa  377  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.7 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.16 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 297 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.01 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.16 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3308  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.29 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242939  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1073  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.57 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.36 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>