More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1135 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1135  dTDP-glucose pyrophosphorylase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.12196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  74.15 
 
 		 294 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.33 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  72.45 
 
 		 292 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  69.83 
 
 		 296 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2049  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  71.33 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1570  dTDP-glucose pyrophosphorylase  71.58 
 
 		 298 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  69.28 
 
 		 300 aa  425  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.01 
 
 		 292 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.19 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.09 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.43 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 294 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.71 
 
 		 292 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.48 
 
 		 291 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 292 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.4 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 292 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.05 
 
 		 294 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.71 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  69.29 
 
 		 270 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.03 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 		 291 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.4 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 		 289 aa  384  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 		 294 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 		 295 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.23 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.69 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.92 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.67 
 
 		 291 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.86 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 		 310 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.21 
 
 		 289 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.57 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.46 
 
 		 292 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1563  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.86 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.66 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.54 
 
 		 292 aa  377  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.2 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  64.11 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  64.11 
 
 		 294 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.2 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.73 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.32 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.8 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.09 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.6 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.3 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0453677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.61 
 
 		 286 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.63 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.349025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.39 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.73 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  63.19 
 
 		 295 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  62.2 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.17 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.59 
 
 		 296 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 		 297 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.2 
 
 		 305 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.73 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 		 297 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.51 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.27 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.73 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 		 309 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3308  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242939  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0279  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.24 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.643202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.14 
 
 		 289 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.03 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000315653  normal  0.563962 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.44 
 
 		 289 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  63.73 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.73 
 
 		 297 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.86 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4445  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.23 
 
 		 294 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.67 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.43 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.51 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.04 
 
 		 297 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.09 
 
 		 293 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal  1 
 
 
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