More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2395 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  99.32 
 
 
296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  99.31 
 
 
294 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  97.91 
 
 
289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  94.26 
 
 
296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  94.26 
 
 
296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  84.72 
 
 
299 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  84.38 
 
 
296 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.42 
 
 
295 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494959  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1450  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  85.37 
 
 
306 aa  485  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.86 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 
290 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.79 
 
 
287 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 
292 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
296 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.54 
 
 
290 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.44 
 
 
287 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.76 
 
 
296 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.2 
 
 
293 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.46 
 
 
305 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.85 
 
 
293 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.57 
 
 
296 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  63.41 
 
 
293 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0702  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.72 
 
 
307 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00504967  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
297 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.2 
 
 
291 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
293 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
289 aa  377  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
291 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
287 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
289 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
289 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.23 
 
 
299 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
293 aa  374  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.03 
 
 
291 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
296 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
292 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.56 
 
 
296 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
296 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
292 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
296 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.15 
 
 
292 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.45 
 
 
295 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.374251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
296 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.03 
 
 
293 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
290 aa  368  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
293 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
292 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3052  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
298 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.664934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.41 
 
 
289 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.37 
 
 
293 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.28 
 
 
292 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.07 
 
 
293 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.79 
 
 
292 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  60.21 
 
 
289 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
310 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.35 
 
 
293 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.54 
 
 
292 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  62.37 
 
 
292 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
289 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  60.14 
 
 
304 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.02 
 
 
295 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 
292 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1565  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
292 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.52 
 
 
292 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
297 aa  364  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
297 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
297 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
297 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
309 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
293 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.19 
 
 
287 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.92 
 
 
297 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0696  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
294 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53714  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
293 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.89 
 
 
293 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0208  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
287 aa  363  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 
289 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
312 aa  363  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.29 
 
 
292 aa  363  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
288 aa  363  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.56 
 
 
298 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.56 
 
 
298 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.62 
 
 
297 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0865  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.99 
 
 
294 aa  363  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4814  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
292 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1073  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
296 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0626  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.63 
 
 
294 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.353924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.32 
 
 
292 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1570  dTDP-glucose pyrophosphorylase  60.84 
 
 
298 aa  363  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.97 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
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