More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1687 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 356 aa  709    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  67.13 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.85 
 
 		 355 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.9 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  58.07 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.3 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.67 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.37 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.37 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  53.35 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.82 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.82 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.65 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.37 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.69 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.97 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.06 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.56 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  50.28 
 
 		 355 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  51.55 
 
 		 355 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.58 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.4 
 
 		 376 aa  338  9e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.89 
 
 		 355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 		 355 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.85 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.42 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.77 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.6 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.21 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.58 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.29 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.62 
 
 		 349 aa  285  8e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.22 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.14 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.14 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.72 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.72 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.04 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.01 
 
 		 400 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  33.07 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  32.65 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  40.25 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.89 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  32.65 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.62 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.62 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 		 296 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  38.46 
 
 		 243 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 		 296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.72 
 
 		 400 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.75 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.36 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  31.29 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  32.04 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.77 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.47 
 
 		 293 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  33.89 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0210  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.24 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375545  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 235 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 		 820 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  29.36 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.88 
 
 		 296 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.88 
 
 		 296 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.5 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.1 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 253 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.97 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.51 
 
 		 240 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.72 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.96 
 
 		 291 aa  157  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.85 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  32.84 
 
 		 411 aa  155  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1440  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.03 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>