More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2643 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 354 aa  710    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.51 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.21 
 
 		 358 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.24 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.6 
 
 		 376 aa  285  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  45.1 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.87 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.59 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.01 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.29 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.85 
 
 		 357 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.85 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.34 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.02 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.44 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.17 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  42.58 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.5 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.82 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.33 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.83 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.59 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.6 
 
 		 355 aa  272  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.9 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.81 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.89 
 
 		 357 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.24 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.9 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  42.17 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.03 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.11 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.14 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.15 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.88 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.14 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.94 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.03 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  39.58 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  37.6 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.39 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  37.32 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.93 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  37.11 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  37.11 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  37.42 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.11 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  34.99 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 396 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.4 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  36.94 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  33.14 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.9 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  32.68 
 
 		 331 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  32.12 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.53 
 
 		 405 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  32.05 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  38.31 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  39.35 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  38.06 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.31 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 247 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.56 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.84 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  37.11 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.69 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.81 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  32.67 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 253 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 248 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  27.74 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  37.54 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  38.66 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  36.56 
 
 		 257 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  32.78 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.14 
 
 		 392 aa  142  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  37 
 
 		 245 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  34.56 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  34.04 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  40.44 
 
 		 244 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  31.31 
 
 		 392 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  36.51 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.66 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  31.27 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.82 
 
 		 240 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.29 
 
 		 399 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  39.38 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.65 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 370 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>