More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0340 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 355 aa  710    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.51 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.18 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.49 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.32 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.33 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.31 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.22 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.94 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.94 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.07 
 
 		 355 aa  289  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.96 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  44.66 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.51 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.66 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.21 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.82 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.49 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.01 
 
 		 357 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.01 
 
 		 357 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.06 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.01 
 
 		 357 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.56 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  41.62 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.78 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.24 
 
 		 355 aa  271  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.94 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.9 
 
 		 357 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.53 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.14 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.73 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.56 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  41.97 
 
 		 355 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.19 
 
 		 344 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.75 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.85 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.04 
 
 		 351 aa  225  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  37.69 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.1 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  34.56 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  37.91 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.55 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.44 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  33.99 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.82 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  36.42 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  32.49 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.99 
 
 		 325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.26 
 
 		 400 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  32.94 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  32.87 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  33.83 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.86 
 
 		 405 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  35.8 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  38.74 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  36.19 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  35.51 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  36.5 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.79 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  30.45 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  34.99 
 
 		 392 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 		 392 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  37.84 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  37.3 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  32.26 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 		 247 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 244 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  32.84 
 
 		 399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  39.21 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.37 
 
 		 245 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.37 
 
 		 245 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  37.87 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.37 
 
 		 245 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  38.21 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 		 245 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  32.33 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 248 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  34.96 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.96 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.96 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  30.23 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  35.54 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.96 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  35.17 
 
 		 253 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  34.5 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.83 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>