More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4141 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
253 aa  523  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  69.87 
 
 
243 aa  353  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  62.96 
 
 
245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.96 
 
 
245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.96 
 
 
245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.96 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.96 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.55 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  62.55 
 
 
245 aa  325  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.14 
 
 
245 aa  324  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.55 
 
 
245 aa  324  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.55 
 
 
245 aa  324  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0937  nucleotidyl transferase  60.91 
 
 
257 aa  318  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  57.38 
 
 
257 aa  291  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  57.81 
 
 
239 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  56.3 
 
 
244 aa  278  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.95 
 
 
240 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  57.51 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  58.87 
 
 
235 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  49.36 
 
 
292 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1570  dTDP-glucose pyrophosphorylase  49.36 
 
 
298 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.86 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  48.07 
 
 
292 aa  214  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1283  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.89 
 
 
295 aa  214  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0774  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  47.16 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  50.43 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  48.07 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.64 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.64 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.64 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.16 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.64 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.64 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.64 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3308  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.38 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242939  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  48.03 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  48.03 
 
 
294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.11 
 
 
289 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1836  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.09 
 
 
290 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2993  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.09 
 
 
298 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.776676  normal  0.308092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.6 
 
 
294 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00988  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.96 
 
 
293 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2896  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.5 
 
 
288 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.257197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.64 
 
 
293 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.73 
 
 
291 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.56 
 
 
302 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.87 
 
 
293 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.06 
 
 
292 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.87 
 
 
310 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.69 
 
 
289 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.87 
 
 
293 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.15 
 
 
296 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.45 
 
 
289 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.78 
 
 
291 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0826  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.86 
 
 
291 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0797  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.86 
 
 
291 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.64 
 
 
296 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.52 
 
 
294 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.18 
 
 
290 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.81 
 
 
286 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.572504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.53 
 
 
294 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.45 
 
 
286 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  45.87 
 
 
294 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  45.87 
 
 
294 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.72 
 
 
312 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.28 
 
 
286 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0064  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.26 
 
 
304 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.64 
 
 
287 aa  205  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.58 
 
 
293 aa  204  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.81 
 
 
293 aa  204  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.87 
 
 
293 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.87 
 
 
296 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.83 
 
 
289 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2035  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.26 
 
 
304 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.02 
 
 
291 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.26 
 
 
289 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.44 
 
 
296 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.54 
 
 
294 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338319  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.51 
 
 
300 aa  203  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.06 
 
 
289 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.8 
 
 
288 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.47 
 
 
286 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
312 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  45.23 
 
 
295 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.41 
 
 
297 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.85 
 
 
297 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.91 
 
 
294 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.49 
 
 
292 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.06 
 
 
291 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.35 
 
 
296 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.87 
 
 
292 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008817  P9515_14101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.92 
 
 
296 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.659652  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.53 
 
 
296 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.26 
 
 
296 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
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