More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2754 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
355 aa  708    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  78.31 
 
 
357 aa  559  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.24 
 
 
358 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.89 
 
 
357 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
355 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.26 
 
 
356 aa  359  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 
358 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.34 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.34 
 
 
357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.76 
 
 
358 aa  355  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  47.49 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
354 aa  352  8e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.94 
 
 
354 aa  349  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.74 
 
 
355 aa  347  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.48 
 
 
364 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.38 
 
 
357 aa  346  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.02 
 
 
356 aa  345  5e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.17 
 
 
355 aa  344  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.26 
 
 
356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.78 
 
 
357 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.74 
 
 
355 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.74 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
355 aa  339  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  50 
 
 
355 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.58 
 
 
355 aa  328  7e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  48.88 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.98 
 
 
355 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
359 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
355 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.04 
 
 
357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.02 
 
 
376 aa  308  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.69 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.07 
 
 
355 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.6 
 
 
354 aa  288  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.38 
 
 
353 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.53 
 
 
344 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.68 
 
 
351 aa  258  9e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.26 
 
 
320 aa  204  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.84 
 
 
400 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  35.39 
 
 
365 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.85 
 
 
400 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.88 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.46 
 
 
296 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.49 
 
 
400 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.74 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.03 
 
 
245 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  41.45 
 
 
245 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
396 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.6 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.6 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
325 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.6 
 
 
245 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.6 
 
 
245 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.6 
 
 
245 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
411 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  39.47 
 
 
402 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 
296 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 
294 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
245 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.19 
 
 
289 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.77 
 
 
296 aa  175  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  40.17 
 
 
245 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
245 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.35 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.96 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.59 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
411 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
296 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.51 
 
 
290 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
289 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 
296 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 
296 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
296 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 
298 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.23 
 
 
325 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
290 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 
298 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
290 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.91 
 
 
294 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  32.63 
 
 
411 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
287 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
287 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
289 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0826  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.66 
 
 
291 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0797  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.66 
 
 
291 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 
298 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
292 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1836  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.84 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.17 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2993  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.84 
 
 
298 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.776676  normal  0.308092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.76 
 
 
405 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  40.49 
 
 
294 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  40.49 
 
 
294 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  38.28 
 
 
402 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.03 
 
 
300 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
295 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>