More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4128 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
355 aa  718    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  94.93 
 
 
355 aa  696    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  80.85 
 
 
355 aa  592  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  74.37 
 
 
355 aa  548  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.73 
 
 
355 aa  431  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.6 
 
 
358 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.04 
 
 
356 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  57.06 
 
 
355 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.9 
 
 
358 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  57.1 
 
 
355 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.78 
 
 
355 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.82 
 
 
357 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.56 
 
 
357 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.85 
 
 
357 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.85 
 
 
354 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.82 
 
 
356 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 
357 aa  362  4e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.3 
 
 
355 aa  359  5e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  49.86 
 
 
358 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
355 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.01 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.2 
 
 
364 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.03 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.42 
 
 
356 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
357 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.85 
 
 
359 aa  344  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
355 aa  343  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.72 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.63 
 
 
357 aa  333  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
357 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.66 
 
 
358 aa  298  8e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 
354 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.2 
 
 
344 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.59 
 
 
354 aa  281  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.06 
 
 
353 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.63 
 
 
349 aa  277  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.24 
 
 
355 aa  271  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.57 
 
 
351 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.53 
 
 
397 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
365 aa  199  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.72 
 
 
320 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 
353 aa  186  8e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.92 
 
 
300 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
293 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.25 
 
 
296 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.6 
 
 
245 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0210  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375545  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.23 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.6 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1494  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
287 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.02 
 
 
245 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  38.82 
 
 
291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1983  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
245 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.14 
 
 
294 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  37.13 
 
 
289 aa  173  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.75 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.17 
 
 
245 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.17 
 
 
245 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.37 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  37.13 
 
 
253 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.17 
 
 
245 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.42 
 
 
400 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
235 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  35.01 
 
 
411 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  35.74 
 
 
245 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
289 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  36.17 
 
 
245 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
294 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
294 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.74 
 
 
245 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  37.1 
 
 
243 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
292 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.63 
 
 
307 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
305 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
296 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
294 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.43 
 
 
296 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
294 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
290 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
294 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
289 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
289 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
292 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
296 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
289 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.83 
 
 
405 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  37.29 
 
 
270 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
291 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.08 
 
 
299 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
289 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.08 
 
 
286 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.23 
 
 
400 aa  169  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
296 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.91 
 
 
293 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.33 
 
 
290 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>