More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0666 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  818    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  61.15 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  58.9 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  60.45 
 
 		 401 aa  508  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  58.4 
 
 		 399 aa  485  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  48.37 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  48.87 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  49.37 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.32 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  44.3 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  43.72 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  42.33 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  43.95 
 
 		 411 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  43.95 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  41.37 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  42.53 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  41.56 
 
 		 414 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  40.1 
 
 		 393 aa  298  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  41.58 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  40.82 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  40.55 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  40.46 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  40.7 
 
 		 403 aa  289  7e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  38.42 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.36 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  34.24 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.64 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  36.63 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.9 
 
 		 393 aa  242  6e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  34.39 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.97 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.66 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  35.76 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.97 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.47 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.9 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  32.22 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.87 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.61 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.32 
 
 		 349 aa  176  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.65 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  29.5 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  28.93 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.53 
 
 		 351 aa  171  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 		 376 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.75 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  31.52 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.34 
 
 		 355 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.34 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  30.93 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.94 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.21 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.95 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.11 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.15 
 
 		 355 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  31.69 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.26 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.13 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.72 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.23 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.13 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.15 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.38 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  30.9 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.84 
 
 		 354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.25 
 
 		 355 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  28.71 
 
 		 816 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.16 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.17 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.63 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.63 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  28.79 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  29.77 
 
 		 820 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73220  glucosamine-1-phosphate acetyltransferase/N-acetyl  28.92 
 
 		 454 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  27.16 
 
 		 854 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  30.84 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6354  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  28.7 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  29.47 
 
 		 828 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  30.24 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  28.28 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.61 
 
 		 353 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.91 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.12 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.09 
 
 		 357 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1538  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.54 
 
 		 459 aa  145  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.855083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  27.51 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.61 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  30.59 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>