More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0048 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.06 
 
 		 297 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.75 
 
 		 297 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.4 
 
 		 312 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 292 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.01 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.01 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.36 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0237145 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.66 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1715  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.89 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.703429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.36 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.06 
 
 		 297 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.36 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.36 
 
 		 297 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.01 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  68.06 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
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NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.48 
 
 		 296 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 295 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.43 
 
 		 292 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3970  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00629806  normal  0.592005 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3801  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.13 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.42 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  66.43 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.08 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.43 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15940  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.37 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.08 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00988  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.08 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.13 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.71 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.75 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  68.07 
 
 		 291 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.08 
 
 		 289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1989  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.36 
 
 		 297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112346  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 294 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
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NC_007404  Tbd_1779  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.149846  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0123  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.61 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.85 
 
 		 294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.78 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.16 
 
 		 292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.02 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 		 294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00736153 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 		 289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 		 294 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0279  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.61 
 
 		 309 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.643202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0637  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  66.43 
 
 		 310 aa  401  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210198  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.03 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2101  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.26 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.338319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.41 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.83 
 
 		 293 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 		 298 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3386  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.19 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.718729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2435  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.03 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704371 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.89 
 
 		 298 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.24 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 		 298 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3489  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.02 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.374251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0774  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  64.69 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.51 
 
 		 296 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340468 
 
 
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NC_009720  Xaut_3556  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.82 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305082  normal  0.867096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.21 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.32 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0399407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.99 
 
 		 289 aa  398  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.43 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1406  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.85 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0680028  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.91 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5902  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.96 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.38 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1565  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.69 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.26 
 
 		 296 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 293 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  63.64 
 
 		 289 aa  394  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  68.05 
 
 		 270 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  67.72 
 
 		 290 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.314543 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.28 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.73 
 
 		 310 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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