More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7294 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 330 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  46.06 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.92 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  44.51 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  44.55 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  43.81 
 
 		 325 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.12 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  42.6 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  41.21 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  40.48 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  41.39 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  41.09 
 
 		 331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  40.54 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  40.18 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.83 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  36.72 
 
 		 332 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  35.95 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.63 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  31.87 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.28 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.6 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.28 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.86 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.92 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.81 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.05 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.45 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.06 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.71 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.22 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.05 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.49 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.41 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.8 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.09 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.13 
 
 		 355 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.9 
 
 		 357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.32 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  34.12 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.08 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.39 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.28 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.59 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.55 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.78 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  30.46 
 
 		 396 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.72 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  31.91 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.89 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.25 
 
 		 357 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.25 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.22 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  29.28 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.65 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.22 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.66 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.87 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.27 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.74 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.21 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.66 
 
 		 400 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  33.14 
 
 		 411 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  32.16 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.54 
 
 		 414 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.26 
 
 		 376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.12 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  27.67 
 
 		 402 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 402 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  28.74 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.03 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.42 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.24 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  29.15 
 
 		 253 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  27.41 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  28.68 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  29.19 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  26.62 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  25.51 
 
 		 393 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  27.38 
 
 		 392 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  29.97 
 
 		 400 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.52 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  31.01 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  25.7 
 
 		 391 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  27.68 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  27.07 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.43 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  27.11 
 
 		 367 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  30.04 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  28.02 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.62 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.87 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1811  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.18 
 
 		 255 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  25.88 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.9 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>