More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2775 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
324 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  55.38 
 
 
329 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  54.13 
 
 
331 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  54.74 
 
 
331 aa  348  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  50.46 
 
 
330 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  44.51 
 
 
326 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  44.82 
 
 
325 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  43.73 
 
 
325 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  45.26 
 
 
325 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  44 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44 
 
 
349 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  41.41 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.48 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  40.48 
 
 
330 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  36.53 
 
 
328 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  40.84 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
336 aa  191  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 
328 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.23 
 
 
333 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  32.05 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  31.07 
 
 
336 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.5 
 
 
355 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.1 
 
 
354 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.06 
 
 
358 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.26 
 
 
354 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.08 
 
 
354 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.08 
 
 
353 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.4 
 
 
357 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.29 
 
 
356 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.7 
 
 
359 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.9 
 
 
344 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.1 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.68 
 
 
397 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30 
 
 
355 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.44 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.11 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.02 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.86 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.51 
 
 
357 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.25 
 
 
357 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.23 
 
 
357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.23 
 
 
357 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.36 
 
 
357 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.11 
 
 
357 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.25 
 
 
355 aa  126  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.73 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.09 
 
 
356 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.32 
 
 
351 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  30.21 
 
 
393 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.82 
 
 
376 aa  122  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.77 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.94 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  29.48 
 
 
358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  31.31 
 
 
393 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.82 
 
 
355 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.38 
 
 
405 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 
392 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
400 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.74 
 
 
393 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.53 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
396 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.74 
 
 
399 aa  116  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.45 
 
 
355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.48 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.38 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.48 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  29.45 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.59 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.9 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  30.06 
 
 
414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.99 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  32.07 
 
 
835 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.23 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  27.19 
 
 
397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.37 
 
 
356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.27 
 
 
353 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.33 
 
 
355 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 
359 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  28.19 
 
 
399 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
358 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  31.29 
 
 
439 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
365 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31.87 
 
 
832 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  31.21 
 
 
402 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  31.45 
 
 
402 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
387 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  28.8 
 
 
411 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  30.2 
 
 
387 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.51 
 
 
830 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
832 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  30.82 
 
 
359 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  27.89 
 
 
391 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.94 
 
 
405 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
399 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
393 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.01 
 
 
358 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>