More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0881 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  96.98 
 
 
331 aa  656    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  100 
 
 
331 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  60.24 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  51.52 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  54.13 
 
 
324 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  47.42 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  47.42 
 
 
325 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  48.01 
 
 
325 aa  300  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  46.79 
 
 
326 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  45.87 
 
 
325 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  47.11 
 
 
325 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  46.79 
 
 
349 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.44 
 
 
331 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  41.41 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  41.37 
 
 
332 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  40.18 
 
 
330 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.67 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  35.61 
 
 
338 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  34.02 
 
 
336 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  35.31 
 
 
336 aa  205  8e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 
328 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.8 
 
 
355 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.12 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.68 
 
 
344 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.17 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.53 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.58 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.37 
 
 
355 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.42 
 
 
349 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.81 
 
 
353 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.97 
 
 
355 aa  143  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.37 
 
 
355 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.93 
 
 
355 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.47 
 
 
355 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.53 
 
 
354 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.33 
 
 
358 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.77 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.36 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.04 
 
 
355 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.25 
 
 
354 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.27 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.27 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.02 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.61 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  31.1 
 
 
393 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.52 
 
 
356 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.86 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.57 
 
 
351 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.16 
 
 
357 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.36 
 
 
358 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  30.03 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.28 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.96 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.53 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.53 
 
 
355 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.97 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.85 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.78 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.76 
 
 
356 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.14 
 
 
365 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
411 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.89 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  27.92 
 
 
397 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  30.77 
 
 
358 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
247 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.53 
 
 
411 aa  123  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.58 
 
 
358 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.53 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  30.16 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  29.73 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.79 
 
 
411 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.8 
 
 
364 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  29.39 
 
 
402 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.54 
 
 
374 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.86 
 
 
405 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  29.17 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.15 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.09 
 
 
320 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  26.14 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.78 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.6 
 
 
400 aa  109  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  29.17 
 
 
257 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  30.74 
 
 
248 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
245 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 
400 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
405 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  26.79 
 
 
384 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  27.38 
 
 
403 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  25.86 
 
 
383 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  29.28 
 
 
370 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 
370 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 
833 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  25.15 
 
 
403 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  25.43 
 
 
392 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.9 
 
 
400 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  25.66 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>