More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0729 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 332 aa  672    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  37.28 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  36.92 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  41.07 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  40.36 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  41.37 
 
 		 331 aa  242  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.31 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  37.43 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  40.84 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.53 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  36.72 
 
 		 330 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  35.63 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.39 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  33.23 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.42 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  30.21 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.75 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.29 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  27.96 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.41 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.65 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.94 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.08 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.92 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.17 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.27 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.35 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.51 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.22 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.86 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.04 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.25 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.57 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.09 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.46 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.65 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.79 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.27 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.87 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.71 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.75 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.32 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.83 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  26.78 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.09 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.69 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.7 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.1 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  25.46 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  22.84 
 
 		 414 aa  105  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  28.44 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.91 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.91 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.23 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.01 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.33 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  26.45 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.99 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.34 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.85 
 
 		 393 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.22 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  25.85 
 
 		 411 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  29.15 
 
 		 402 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  24.4 
 
 		 411 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.4 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.15 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25.64 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  27.75 
 
 		 402 aa  92.8  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.22 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  29.13 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  27.81 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.85 
 
 		 411 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  29.67 
 
 		 364 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.5 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  27.17 
 
 		 833 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  25.34 
 
 		 820 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 		 405 aa  86.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.89 
 
 		 312 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.47 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3830  Nucleotidyl transferase  28.49 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2993  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.96 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.776676  normal  0.308092 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.72 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1811  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.89 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1836  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.96 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  28 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.74 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  26.36 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  27.1 
 
 		 830 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  24.65 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1540  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.25 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.61 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  30.33 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>