More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0511 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 
290 aa  579  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.51 
 
 
297 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3075  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.01 
 
 
293 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.11788 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  65.74 
 
 
292 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0938  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.46 
 
 
290 aa  384  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2240  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
305 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.56 
 
 
286 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.5 
 
 
296 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.942362  decreased coverage  0.00289209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  64.01 
 
 
294 aa  381  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.59 
 
 
291 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
287 aa  381  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.11 
 
 
289 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  63.67 
 
 
295 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  64.01 
 
 
294 aa  381  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.21 
 
 
289 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.12 
 
 
293 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.72 
 
 
292 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.16 
 
 
289 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
293 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
292 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.25 
 
 
293 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1299  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
291 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
293 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0479  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
293 aa  377  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.778561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.11 
 
 
293 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
289 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.9 
 
 
310 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  64.54 
 
 
289 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3464  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.75 
 
 
293 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_002950  PG1563  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.67 
 
 
289 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3186  glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase  62.32 
 
 
304 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
296 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4056  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.41 
 
 
296 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2858  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.46 
 
 
289 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0450568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2131  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
297 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1473  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.89 
 
 
287 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.905305  normal  0.376761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.81 
 
 
286 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.72 
 
 
290 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2411  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  63.54 
 
 
290 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000385967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
288 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.64 
 
 
293 aa  371  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0625  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
290 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.85 
 
 
292 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3933  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.68 
 
 
296 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.527502  normal  0.192647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.23 
 
 
291 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.19 
 
 
293 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  61.4 
 
 
289 aa  373  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0865  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
294 aa  369  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.79 
 
 
295 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1914  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.11 
 
 
298 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1073  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
296 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.4 
 
 
291 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.28 
 
 
291 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.21 
 
 
305 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1998  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  62.76 
 
 
299 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000687148  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  61.05 
 
 
293 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.93 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  59.79 
 
 
292 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4134  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
293 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.886764  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3016  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.95 
 
 
289 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00414881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.75 
 
 
296 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 
288 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3801  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.14 
 
 
292 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636815  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.69 
 
 
289 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.69 
 
 
290 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.51 
 
 
294 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
293 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1270  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.69 
 
 
289 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106852  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.07 
 
 
298 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.79 
 
 
297 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.82 
 
 
291 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.86 
 
 
292 aa  364  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.51 
 
 
294 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
293 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.72 
 
 
298 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0453677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1894  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.76 
 
 
292 aa  364  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284713  normal  0.0266706 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1440  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.45 
 
 
291 aa  364  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.39 
 
 
297 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.36 
 
 
297 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.36 
 
 
297 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.7 
 
 
291 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.31 
 
 
290 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.15 
 
 
294 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.15 
 
 
294 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.36 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1470  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.01 
 
 
312 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.759037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0762  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  56.75 
 
 
297 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.1 
 
 
297 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  59.51 
 
 
292 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0826  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
291 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0797  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60.98 
 
 
291 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  58.8 
 
 
305 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  57.79 
 
 
297 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>