More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2761 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
320 aa  651    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  60.32 
 
 
315 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  57.91 
 
 
324 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  56.83 
 
 
311 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  54.89 
 
 
319 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  58.31 
 
 
310 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  49.5 
 
 
310 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.37 
 
 
343 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3833  Nucleotidyl transferase  32.05 
 
 
345 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.863849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  32.05 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3692  nucleotidyl transferase  30.86 
 
 
345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
832 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.45 
 
 
784 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  31.45 
 
 
784 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.45 
 
 
784 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  31.45 
 
 
784 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
329 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  31.45 
 
 
784 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.48 
 
 
784 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
832 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.48 
 
 
784 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.1 
 
 
784 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  30.61 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
346 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1919  Nucleotidyl transferase  31.68 
 
 
303 aa  136  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  29.48 
 
 
366 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.34 
 
 
784 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  35.21 
 
 
843 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  31.34 
 
 
784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  28.88 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.62 
 
 
785 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.65 
 
 
840 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  28.35 
 
 
347 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.98 
 
 
841 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.77 
 
 
842 aa  129  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  27.71 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  27.83 
 
 
835 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  27.69 
 
 
370 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  27.76 
 
 
818 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  26.93 
 
 
835 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6775  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 
334 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.52 
 
 
828 aa  125  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3818  nucleotidyl transferase  28.49 
 
 
344 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0106191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.61 
 
 
836 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  28.2 
 
 
843 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
830 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.31 
 
 
842 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  29.1 
 
 
361 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  26.23 
 
 
835 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  29.07 
 
 
818 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  28.19 
 
 
828 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  29.1 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  27.66 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  28.1 
 
 
820 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  30.28 
 
 
362 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  26.01 
 
 
836 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.27 
 
 
836 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  29.49 
 
 
854 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  25.7 
 
 
836 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 
361 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.48 
 
 
810 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  27.44 
 
 
364 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.3 
 
 
830 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  25.8 
 
 
349 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  26.79 
 
 
833 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 
833 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  28.71 
 
 
834 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  26.8 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  28.05 
 
 
820 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  27.81 
 
 
835 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.05 
 
 
712 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0531  nucleotidyl transferase  28.43 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
222 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  28.13 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  29.97 
 
 
842 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  28.3 
 
 
816 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.49 
 
 
389 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.22 
 
 
392 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  26.44 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  26.44 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.78 
 
 
392 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  29.66 
 
 
832 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.22 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.52 
 
 
392 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  30.04 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.89 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  32.39 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.44 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.63 
 
 
392 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
223 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  26.64 
 
 
827 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  28.43 
 
 
828 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>