More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0531 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0531  nucleotidyl transferase  100 
 
 
324 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  43.72 
 
 
581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
329 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  35.27 
 
 
248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  31.29 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1919  Nucleotidyl transferase  32.48 
 
 
303 aa  126  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.58 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30.06 
 
 
834 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  29.86 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  28.43 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  25.68 
 
 
348 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  26.98 
 
 
776 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  27.64 
 
 
820 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.88 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
347 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  28.49 
 
 
832 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
827 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  28.75 
 
 
324 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  27.38 
 
 
315 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  25.86 
 
 
399 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  25.97 
 
 
370 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
319 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 
370 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  30.35 
 
 
310 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.4 
 
 
392 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.4 
 
 
392 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3833  Nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
345 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.863849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.5 
 
 
392 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
347 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3692  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 
345 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  28.17 
 
 
828 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  31.38 
 
 
348 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.55 
 
 
392 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  26.26 
 
 
388 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.63 
 
 
392 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  26.26 
 
 
388 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  27.16 
 
 
832 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0204  nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
311 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  27.64 
 
 
827 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.63 
 
 
389 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  28.05 
 
 
843 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  25.6 
 
 
712 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  24.78 
 
 
370 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.35 
 
 
392 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.98 
 
 
836 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  27.3 
 
 
833 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.63 
 
 
392 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.21 
 
 
364 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.28 
 
 
842 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  29.5 
 
 
359 aa  99.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  26.22 
 
 
830 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  25.79 
 
 
785 aa  99  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  28.7 
 
 
830 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  25.84 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  24.29 
 
 
392 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  25.08 
 
 
818 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
835 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  25.23 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  25.15 
 
 
835 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.12 
 
 
392 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
370 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  27.19 
 
 
365 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.06 
 
 
392 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.48 
 
 
828 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  25.85 
 
 
835 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  25.6 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  29.19 
 
 
357 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  26.76 
 
 
832 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
222 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  25.6 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  26.83 
 
 
833 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  27.49 
 
 
841 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  35.43 
 
 
230 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 
842 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  26.61 
 
 
820 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
810 aa  92.8  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  23.82 
 
 
389 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  23.94 
 
 
835 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  25.29 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  27.44 
 
 
818 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.08 
 
 
836 aa  92.4  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  23.55 
 
 
388 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  28.66 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
222 aa  92.4  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  35.02 
 
 
223 aa  92.4  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  27.83 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  25.83 
 
 
840 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  27.61 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  25.53 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  27.61 
 
 
821 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  42.75 
 
 
229 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  22.99 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  34.68 
 
 
236 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
232 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  26.81 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  26.52 
 
 
364 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  39.09 
 
 
229 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>