More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4487 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  93.39 
 
 		 243 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  72.02 
 
 		 243 aa  354  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  72.84 
 
 		 243 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  72.02 
 
 		 243 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  70.9 
 
 		 244 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  71.72 
 
 		 243 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  58.68 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.93 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  32.37 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  31.38 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  32.38 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  30.17 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  30.23 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.11 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  30.17 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.92 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.77 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  35.03 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.39 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  27.73 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  31.37 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  32.12 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  38.6 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.16 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.33 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.69 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.22 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  26.64 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  32.23 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  29.02 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  31.71 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.71 
 
 		 325 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.39 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.6 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  38.32 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.3 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  30.05 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  40.37 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.04 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  34.23 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  30.95 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.93 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.71 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  32.28 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  32.42 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.19 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.39 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.68 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  33.02 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  31.11 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  33.52 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  41.56 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  44.87 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.31 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.04 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  26.67 
 
 		 476 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.02 
 
 		 355 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 		 348 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  25.74 
 
 		 360 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0861  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506105  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  27.76 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  34.45 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.89 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  30.1 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 		 776 aa  55.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  31.1 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  27.2 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3692  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 		 345 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  24.12 
 
 		 712 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  39.81 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  43.75 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  25.43 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.53 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>