More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14051 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  100 
 
 
356 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  38.35 
 
 
355 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  40.18 
 
 
352 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  35.76 
 
 
348 aa  249  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
353 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  32.64 
 
 
476 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
350 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  35.59 
 
 
351 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.63 
 
 
352 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
350 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  34.66 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  34.99 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  37.65 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  37.2 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  37.65 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
360 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  36.7 
 
 
352 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  34.24 
 
 
351 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  33.53 
 
 
352 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.31 
 
 
320 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.78 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  34.88 
 
 
346 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.98 
 
 
353 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  35.38 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  32.1 
 
 
351 aa  212  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  32.52 
 
 
341 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  32.52 
 
 
341 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  32.65 
 
 
361 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
367 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  32.32 
 
 
354 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 
349 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  34.4 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  39.37 
 
 
396 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
238 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 
816 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 
828 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
818 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  36.24 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  34.39 
 
 
820 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  31.51 
 
 
229 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
830 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
810 aa  132  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  32.29 
 
 
820 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
828 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
827 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  31.39 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  30.97 
 
 
238 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  31.7 
 
 
843 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
832 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  30.45 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
841 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 
854 aa  129  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.49 
 
 
833 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  30.04 
 
 
843 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.04 
 
 
832 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
830 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  38.95 
 
 
234 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.8 
 
 
842 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.73 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  33.03 
 
 
240 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  34.5 
 
 
784 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.5 
 
 
784 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  34.5 
 
 
784 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  34.5 
 
 
784 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  33.19 
 
 
361 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.5 
 
 
784 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  34.5 
 
 
784 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  34.5 
 
 
784 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  32 
 
 
840 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  31.98 
 
 
827 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  32 
 
 
832 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  33.19 
 
 
361 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
835 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  33.8 
 
 
237 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
359 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  31.05 
 
 
267 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  31.08 
 
 
370 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
784 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  33.48 
 
 
784 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.96 
 
 
828 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  33.48 
 
 
784 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  30.91 
 
 
365 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
841 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
834 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
833 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  29.69 
 
 
821 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  34.85 
 
 
237 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  31.22 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
818 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
785 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 
370 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  39.08 
 
 
230 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.67 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>