More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2585 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  100 
 
 
367 aa  768    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
351 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  42.73 
 
 
361 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  41.94 
 
 
350 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  41.94 
 
 
350 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  40.12 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  43.28 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  41.62 
 
 
352 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  40.99 
 
 
351 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  43.57 
 
 
352 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  38.84 
 
 
348 aa  276  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  42.18 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 
346 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  39.51 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  41.23 
 
 
351 aa  268  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  38.37 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  40.12 
 
 
352 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  40.12 
 
 
352 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  38.69 
 
 
352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  36 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.46 
 
 
320 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.48 
 
 
353 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  36.69 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  36.07 
 
 
355 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  34.77 
 
 
360 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  36.98 
 
 
341 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  36.33 
 
 
341 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  34.2 
 
 
345 aa  227  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.43 
 
 
356 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
354 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  29.58 
 
 
348 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 
238 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
349 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  34.5 
 
 
237 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 
238 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  34.55 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 
238 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.53 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.93 
 
 
347 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
238 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  34.03 
 
 
357 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  31.22 
 
 
267 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.75 
 
 
784 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  37.57 
 
 
820 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  31.43 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.75 
 
 
784 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
237 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
785 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  30.71 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
818 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  32.31 
 
 
784 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
827 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.41 
 
 
854 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  30.73 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  32.31 
 
 
784 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.31 
 
 
784 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.31 
 
 
784 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  32.31 
 
 
784 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  32.31 
 
 
784 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  32.16 
 
 
784 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
832 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  32.79 
 
 
836 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  32.51 
 
 
836 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
816 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
842 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
828 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  33.5 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
835 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.72 
 
 
784 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 
821 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  27.8 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  32.31 
 
 
835 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  28.05 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
227 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
399 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
228 aa  113  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  36.46 
 
 
227 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
230 aa  113  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  31 
 
 
832 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.72 
 
 
837 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.21 
 
 
833 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
351 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  30.84 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.08 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
835 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.44 
 
 
830 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 
359 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  28.75 
 
 
243 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  36.11 
 
 
228 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
835 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>