More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4179 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
365 aa  717    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  70.17 
 
 
359 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  66.01 
 
 
359 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  65.66 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  66.01 
 
 
359 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  64.89 
 
 
359 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  66.01 
 
 
359 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  66.01 
 
 
359 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  68.38 
 
 
359 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  63.48 
 
 
359 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  60.17 
 
 
370 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  62.54 
 
 
357 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  64.23 
 
 
357 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  56.67 
 
 
364 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  57.75 
 
 
364 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  56.51 
 
 
364 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  57.96 
 
 
336 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  56.86 
 
 
351 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  38.01 
 
 
349 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  41.73 
 
 
366 aa  238  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  36.9 
 
 
370 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  36.63 
 
 
370 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
361 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  39.08 
 
 
367 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.8 
 
 
348 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  35.08 
 
 
361 aa  220  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.69 
 
 
361 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  34.41 
 
 
834 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  32.8 
 
 
833 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  35.33 
 
 
821 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
816 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  34.46 
 
 
835 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  32.7 
 
 
827 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.88 
 
 
828 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  31.52 
 
 
830 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  32.35 
 
 
840 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
841 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.7 
 
 
347 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 
827 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  31.45 
 
 
832 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.43 
 
 
347 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
843 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.16 
 
 
842 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  33.51 
 
 
828 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  32.15 
 
 
842 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
854 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
832 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.18 
 
 
776 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  31 
 
 
841 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.16 
 
 
832 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.18 
 
 
828 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  32.71 
 
 
833 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.73 
 
 
843 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.38 
 
 
830 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
820 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.19 
 
 
842 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.17 
 
 
820 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
842 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
835 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.38 
 
 
837 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  30.11 
 
 
818 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.49 
 
 
828 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.95 
 
 
326 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.04 
 
 
810 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.3 
 
 
392 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
346 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
712 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  30.81 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.84 
 
 
836 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.21 
 
 
784 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.21 
 
 
784 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.84 
 
 
836 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  30.19 
 
 
818 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  27.56 
 
 
399 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  27.76 
 
 
835 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
835 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  27.57 
 
 
836 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
784 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  27.98 
 
 
785 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  28.38 
 
 
387 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.31 
 
 
784 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.31 
 
 
784 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.31 
 
 
784 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29.31 
 
 
784 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29 
 
 
784 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  28.8 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.67 
 
 
343 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  26.34 
 
 
784 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  26.34 
 
 
784 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
836 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.88 
 
 
400 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.2 
 
 
400 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
381 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  28.93 
 
 
387 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.16 
 
 
400 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  27.01 
 
 
387 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  29.97 
 
 
388 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.16 
 
 
389 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  28.24 
 
 
376 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>