127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0438 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  63.68 
 
 
223 aa  289  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  60.44 
 
 
225 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  44.35 
 
 
266 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  45.61 
 
 
247 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  46.67 
 
 
230 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  43.29 
 
 
237 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  45.98 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  35.17 
 
 
250 aa  98.6  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.49 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.58 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  31.67 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  30.42 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  39.58 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  40.28 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.86 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.05 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28.22 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  30.29 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  28.15 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  29.17 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.92 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  29.65 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 
263 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  29.88 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  30.24 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  27.59 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  29.05 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.35 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  29.44 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  29.44 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.47 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.75 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  22.28 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.47 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  27.76 
 
 
254 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
253 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  26.72 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  34.65 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  26.72 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  26.72 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  28.31 
 
 
411 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.72 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.32 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.53 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.72 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  23.85 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  26.69 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
392 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  33.64 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  41.18 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25.32 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.52 
 
 
411 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  43.84 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  32.46 
 
 
589 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.8 
 
 
253 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  42.47 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.52 
 
 
411 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 
393 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
397 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.45 
 
 
611 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.18 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
402 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
388 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
596 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  33.15 
 
 
436 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
334 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  26.7 
 
 
821 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.17 
 
 
393 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.07 
 
 
592 aa  45.8  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  33.64 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
393 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4197  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.03 
 
 
456 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.4 
 
 
253 aa  45.4  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2805  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.63 
 
 
455 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.801762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3201  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.63 
 
 
455 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.22 
 
 
393 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  28.8 
 
 
300 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  37.04 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  31.03 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0026  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.98 
 
 
461 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.21 
 
 
393 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  32.79 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  41.07 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  22.54 
 
 
411 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  25.88 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>