More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3873 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 		 630 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  43.55 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  26.72 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  29.12 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.59 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.87 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  29.32 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  34.96 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.59 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  39.52 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  27.95 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  26.36 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  31.37 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  33.86 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  44.94 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.95 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  33.87 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  39.84 
 
 		 391 aa  75.5  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  46.32 
 
 		 400 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  33.86 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  27.76 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  26.4 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  38.58 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  33.59 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  38.76 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  32.37 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  39.82 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  47.19 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  34.33 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  25.29 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  29.12 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  44.21 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.43 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  35.77 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.01 
 
 		 400 aa  72  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  34.48 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.8 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  36.59 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.56 
 
 		 556 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.06 
 
 		 545 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.07 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  28.8 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.37 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  35.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  47.76 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  35.2 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  39.09 
 
 		 595 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.19 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  34.96 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  50.75 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.41 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  26.85 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.4 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.15 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.97 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  41.18 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.49 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  29.8 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  38.14 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.6 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.95 
 
 		 564 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.19 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0205  nucleotidyl transferase  28.79 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  34.4 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3597  Nucleotidyl transferase  42.11 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  37.36 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.4 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.19 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  53.12 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0075  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  33.6 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14401  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>