More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2678 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  65.38 
 
 		 239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  63.09 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  55.65 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 		 245 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  55.02 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  50.63 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  50.63 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  51.93 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  51.06 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  50.61 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  50.88 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  51.6 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  48.67 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  48.28 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  49.35 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  49.12 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  48.92 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  47.35 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  49.56 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  47.64 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  48.47 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  47.79 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  48.05 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  46.98 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  44.64 
 
 		 250 aa  195  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  42.31 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  44.25 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  43.04 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  42.19 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  46.29 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  45.41 
 
 		 221 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  45.5 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  45.22 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  42.92 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  44.74 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  41.96 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  41.96 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  40.34 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  38.63 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  39.48 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.7 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  33.33 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  39.83 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  36.91 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  40.17 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  34.55 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  41.18 
 
 		 222 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  38.14 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  37.18 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  37.22 
 
 		 225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  35.86 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  39.64 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  34.36 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 		 225 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  36.32 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  34.69 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  37.18 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  36.24 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  38.14 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  35.51 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.56 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  36.4 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  37.08 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  36.04 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  36.75 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  36.07 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  37.71 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  34.05 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  34.05 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  36.44 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  37.61 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  38.18 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>