More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1815 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  36.75 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.93 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  29.92 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  28.93 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  30.71 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  30.13 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  29.43 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.46 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  29.96 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  28.1 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  27.08 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.95 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.4 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  32.26 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  27.64 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  27.08 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  27.08 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.44 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.33 
 
 		 400 aa  85.1  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  27.08 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 		 630 aa  85.1  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.25 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.97 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  26.67 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  26.69 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.54 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.81 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  26.77 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  25.81 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  26.67 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.46 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.57 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  27.34 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.45 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.51 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  36.89 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  29.25 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  26.52 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.67 
 
 		 374 aa  78.6  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25.21 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  29.49 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.59 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.38 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  29.38 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  26.91 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  36.04 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  37.11 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.06 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.49 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  24.79 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  30.95 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  32.17 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  25.1 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  29.25 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.48 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.87 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  28.39 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  23.2 
 
 		 376 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  23.97 
 
 		 833 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  23.9 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  34.52 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  29.37 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  28.81 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  29.27 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.68 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.66 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  32.8 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  27.23 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>