More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1406 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 263 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  53.23 
 
 		 249 aa  292  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  44.13 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  44.27 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  43.72 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  39.18 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  37.2 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  36.63 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  33.96 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  33.88 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  32 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  33.6 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.94 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  30.49 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.55 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.05 
 
 		 562 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.64 
 
 		 562 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  26.64 
 
 		 578 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.47 
 
 		 562 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  28.46 
 
 		 561 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.39 
 
 		 545 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.05 
 
 		 561 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.83 
 
 		 561 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.64 
 
 		 561 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.83 
 
 		 561 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  27.67 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.3 
 
 		 556 aa  85.9  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25.1 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  26.8 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.61 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  25.68 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 581 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.8 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.87 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  30.59 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.53 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  27.03 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  50 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  27.51 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3873  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.89 
 
 		 454 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  26.21 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  32.54 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.23 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.41 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.41 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  27.4 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.2 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  35.16 
 
 		 522 aa  65.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  29.59 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  29.27 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  26.91 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  48.33 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0333  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.11 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4745  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.05 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  28.23 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  27.69 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3954  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 454 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000397329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.33 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  24.9 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  29.92 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  50 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3748  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.55 
 
 		 454 aa  62  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 400 aa  62  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.46 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  26.1 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  43.86 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4308  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.32 
 
 		 460 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.135515  hitchhiker  0.000000000173218 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  28.8 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  28.23 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.46 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4895  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.22 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.508264  normal  0.342908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4364  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  46.03 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4200  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.06 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.236226  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4197  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  30.58 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0521  nucleotidyl transferase  23.37 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.75 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4174  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.06 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.92756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002032  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  23.43 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4237  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.016963  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4128  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  0.444756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>