More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0316 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  100 
 
 		 253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  70.24 
 
 		 253 aa  367  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  69.17 
 
 		 253 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  50.79 
 
 		 247 aa  258  9e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  44.27 
 
 		 263 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  41.83 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  44.36 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  37.7 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  34.54 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  36.08 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  32.4 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  31.37 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  28.4 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.12 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  30.31 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  40.54 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  39.64 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  44.94 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  24.9 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  29.25 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  25.9 
 
 		 561 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  23.02 
 
 		 564 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  24.63 
 
 		 578 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.61 
 
 		 562 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.77 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  26.51 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 562 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.23 
 
 		 562 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  37.89 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.34 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  24.61 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  24.61 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  24.61 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  24.61 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  24.61 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  24.61 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  24.61 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  25.19 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.29 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  24.41 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  25.78 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  33.02 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  24.31 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  34.92 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  24.12 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.41 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  58.18 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.57 
 
 		 581 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.38 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  29.44 
 
 		 820 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  42.31 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  26.83 
 
 		 841 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  24.31 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  42.31 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.32 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.49 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  30.3 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  30.62 
 
 		 816 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  22.31 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.54 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  41.18 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  36.46 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.92 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  44.62 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27.78 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  26.51 
 
 		 840 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  24 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  47.69 
 
 		 842 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  21.94 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  22.57 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.05 
 
 		 842 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  22.53 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.1 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  22.39 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  22.53 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  22.53 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0377  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  52.73 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  32.05 
 
 		 842 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  26.88 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.53 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  21.6 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  50.91 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>