More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29421 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  57.81 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  38.78 
 
 		 256 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  39.24 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  38.4 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  39.52 
 
 		 263 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  35.46 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  35.46 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  36.08 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  35.02 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  34.54 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.4 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  26.47 
 
 		 564 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.6 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  25.43 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  25 
 
 		 578 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 561 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 561 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 561 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25 
 
 		 561 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.89 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  25.6 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.91 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.69 
 
 		 545 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.47 
 
 		 562 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.86 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.8 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.49 
 
 		 581 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  23.9 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  27.67 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.07 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.61 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  27.32 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1022 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.38 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  25.2 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.74 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  34.74 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  24.61 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  33.68 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  31.62 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  23.62 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 383 aa  62  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.97 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  26.92 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  27.89 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  26.89 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  27.74 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  29.1 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.45 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  38.71 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  35.25 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  46.55 
 
 		 592 aa  58.9  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  44.64 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  24.02 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0521  nucleotidyl transferase  23.46 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.55 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  34.83 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.21 
 
 		 397 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  41.79 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  47.54 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  29.36 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  49.09 
 
 		 595 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  40.48 
 
 		 522 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  41.43 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  37.14 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.51 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  26.87 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  32.95 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  42.19 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  34.78 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1576  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  22.86 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  33.02 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  22.73 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  40.58 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 590 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  35 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  29.73 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  36.51 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>