More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3867 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  83.54 
 
 		 243 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  82.79 
 
 		 244 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  79.01 
 
 		 243 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  76.64 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  73.14 
 
 		 243 aa  357  9e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  72.02 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  59.09 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  31.12 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.2 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  29.51 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  27.13 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  31.56 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.8 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.74 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  32.48 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.54 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  28.05 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  32.48 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  38.76 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.8 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.08 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.2 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.51 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  40.18 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  37.11 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  35.2 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  21.58 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  39.29 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  27.48 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.23 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  30.57 
 
 		 776 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.29 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  29.8 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  28.44 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  36.31 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  36.28 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  25.61 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  31.76 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.77 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  25.91 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  43.04 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  26.58 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  34.71 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.86 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  26.34 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.82 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  26.96 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.61 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.1 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  36.61 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  25.91 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.08 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  26.51 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.12 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.81 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.32 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  22.31 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  40.51 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.04 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  39.29 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  36.94 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0113  nucleotidyl transferase  30.4 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00523302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  24.89 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  30.89 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  50 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  25.51 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  26.32 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  31.13 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  29.51 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  40.74 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.02 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  38.2 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>