More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3317 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  79.41 
 
 
240 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  40.34 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  40.89 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
220 aa  158  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  40.95 
 
 
230 aa  155  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
222 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  40.99 
 
 
228 aa  152  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  39.21 
 
 
227 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  39.82 
 
 
230 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  39.91 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  37.05 
 
 
362 aa  146  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  38.57 
 
 
228 aa  142  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  34.96 
 
 
364 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.79 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 
366 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
367 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  32.17 
 
 
476 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  34.23 
 
 
841 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
854 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  33.78 
 
 
832 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  32.43 
 
 
833 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3175  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
245 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.71 
 
 
364 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
830 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  36.28 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  33.33 
 
 
364 aa  116  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
361 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  31.44 
 
 
346 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4031  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
245 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 
370 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  35.15 
 
 
346 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  31.65 
 
 
821 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  33.49 
 
 
827 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.98 
 
 
834 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  30 
 
 
835 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  26.75 
 
 
785 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.19 
 
 
828 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.8 
 
 
361 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  25.44 
 
 
348 aa  113  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  35.81 
 
 
358 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
833 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
347 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 
357 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 
776 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  31.8 
 
 
361 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  34.23 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.95 
 
 
827 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
832 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  27.12 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  28.76 
 
 
364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 
359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.66 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
818 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
832 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  24.12 
 
 
348 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  35.68 
 
 
359 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  29.49 
 
 
820 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
365 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
326 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
360 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.88 
 
 
784 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.88 
 
 
784 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.53 
 
 
820 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
346 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  34.84 
 
 
359 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
351 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.88 
 
 
842 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
237 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.15 
 
 
712 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
841 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
329 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.57 
 
 
347 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
363 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  31 
 
 
843 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
828 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  24.03 
 
 
238 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.33 
 
 
836 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  25.82 
 
 
345 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  27.9 
 
 
238 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.33 
 
 
836 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.87 
 
 
842 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1510  nucleotidyl transferase  31.95 
 
 
257 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
840 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 
357 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  32.39 
 
 
352 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  25.88 
 
 
784 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4734  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  30.17 
 
 
257 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0712146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  28.09 
 
 
229 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  34.8 
 
 
359 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3657  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  30.17 
 
 
257 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988629  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.31 
 
 
352 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25 
 
 
784 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25 
 
 
784 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25 
 
 
784 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  25.44 
 
 
784 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
240 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>