More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3113 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1422  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  46.12 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1755  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  44.95 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.385636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  45.78 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1608  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  44.89 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0722  nucleotidyl transferase  41.59 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1744  Nucleotidyl transferase  41.48 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3290  WcbM  37.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0534  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140164  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3276  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.78 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3241  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  37.33 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 370 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 		 370 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  34.06 
 
 		 359 aa  138  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 365 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 833 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 366 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.33 
 
 		 361 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  34.63 
 
 		 412 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.33 
 
 		 361 aa  132  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  34.98 
 
 		 363 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 359 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  32.17 
 
 		 359 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  35.86 
 
 		 408 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  34.78 
 
 		 370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 820 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 359 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 347 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 348 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 		 370 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  30 
 
 		 827 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  34.07 
 
 		 357 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  31.44 
 
 		 841 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  27.9 
 
 		 832 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 357 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 818 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 834 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  36.24 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 776 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.74 
 
 		 828 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31 
 
 		 842 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.33 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.39 
 
 		 827 aa  118  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.3 
 
 		 842 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  31 
 
 		 843 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1636  Nucleotidyl transferase  32.3 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  27.9 
 
 		 835 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 		 843 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  32.46 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 		 364 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  32.07 
 
 		 830 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 		 816 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  32.17 
 
 		 712 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.74 
 
 		 810 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1663  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 828 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 842 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  30.04 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  32.77 
 
 		 364 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.69 
 
 		 784 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 828 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3884  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.883067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  32.9 
 
 		 818 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.69 
 
 		 784 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29 
 
 		 399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 832 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  28.07 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 		 784 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  32.24 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.3 
 
 		 837 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 832 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  29 
 
 		 840 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.26 
 
 		 784 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  25.32 
 
 		 830 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  27.71 
 
 		 841 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  29.79 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  31.03 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>