More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0722 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0722  nucleotidyl transferase  100 
 
 
236 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  47.58 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  41.59 
 
 
231 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1422  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  38.84 
 
 
224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1755  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.53 
 
 
223 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.385636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3276  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.74 
 
 
230 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3290  WcbM  39.74 
 
 
230 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.74 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3241  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.74 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0534  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.74 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.74 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.74 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1608  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  39.27 
 
 
226 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1744  Nucleotidyl transferase  39.57 
 
 
237 aa  151  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  40.57 
 
 
412 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  37.5 
 
 
359 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  42.29 
 
 
230 aa  129  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  40.33 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  37.33 
 
 
370 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
363 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1663  Nucleotidyl transferase  36.68 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  42.79 
 
 
230 aa  125  6e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1636  Nucleotidyl transferase  36.68 
 
 
243 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  37.34 
 
 
366 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  41.86 
 
 
370 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  34.53 
 
 
359 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  42.2 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  35.11 
 
 
370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  39.52 
 
 
408 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 
367 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
359 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
357 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
359 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
348 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  35.39 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  34.13 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  41.35 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  41.46 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  34.5 
 
 
365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  40.78 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
364 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.55 
 
 
364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  37.32 
 
 
237 aa  109  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  33.92 
 
 
357 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.87 
 
 
833 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  34.67 
 
 
351 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
347 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  35.5 
 
 
359 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  33.52 
 
 
832 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  39.32 
 
 
227 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  30.8 
 
 
352 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0612  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
249 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  37.04 
 
 
262 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  36.11 
 
 
843 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  34.51 
 
 
361 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  32.49 
 
 
833 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.67 
 
 
352 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  32.2 
 
 
827 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 
776 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
350 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 
350 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  32.14 
 
 
820 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  33.51 
 
 
364 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  36.06 
 
 
326 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.84 
 
 
820 aa  101  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.16 
 
 
828 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
238 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.65 
 
 
361 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  37.79 
 
 
347 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.69 
 
 
356 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  32.34 
 
 
821 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
358 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
841 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.07 
 
 
361 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  28.39 
 
 
351 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.4 
 
 
414 aa  99  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
828 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
834 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
346 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.61 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3884  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.883067  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.82 
 
 
784 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.82 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.82 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.82 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.57 
 
 
828 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.82 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.82 
 
 
784 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.61 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.82 
 
 
784 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  32.9 
 
 
818 aa  96.3  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  31.76 
 
 
835 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
387 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
832 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  27.04 
 
 
828 aa  95.9  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
827 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>