More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1744 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1744  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  41.48 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0722  nucleotidyl transferase  39.57 
 
 
236 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1422  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  39.91 
 
 
224 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3241  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.53 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3290  WcbM  38.1 
 
 
230 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3276  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.1 
 
 
230 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.1 
 
 
230 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
237 aa  144  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0534  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.1 
 
 
230 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.1 
 
 
230 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  38.1 
 
 
230 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1663  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 
243 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1755  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  39.38 
 
 
223 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.385636  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1636  Nucleotidyl transferase  37.89 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  40.26 
 
 
366 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1608  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  39.38 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  39.32 
 
 
237 aa  122  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  37.02 
 
 
408 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0612  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  34.33 
 
 
365 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  38.05 
 
 
222 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  38.61 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  37 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  34.5 
 
 
412 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
359 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  39.6 
 
 
227 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  35.34 
 
 
359 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 
227 aa  105  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  38.61 
 
 
228 aa  105  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  38.12 
 
 
230 aa  105  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  37.98 
 
 
220 aa  105  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  37.86 
 
 
234 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  31.43 
 
 
370 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  34.93 
 
 
347 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
370 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
370 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  34.67 
 
 
346 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  31.03 
 
 
326 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  35.43 
 
 
351 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  32.6 
 
 
362 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
361 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  32.76 
 
 
359 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  36.1 
 
 
228 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  31.33 
 
 
359 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4933  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.33 
 
 
401 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.05 
 
 
364 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
357 aa  99.8  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
370 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.4 
 
 
364 aa  98.2  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
364 aa  97.1  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.11 
 
 
832 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  32.47 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
357 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
361 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
776 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  29.6 
 
 
835 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
828 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
843 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
359 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
359 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
359 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
411 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  31.88 
 
 
361 aa  92  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
712 aa  92.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  32.59 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  28.38 
 
 
832 aa  91.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.88 
 
 
361 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
411 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
828 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
827 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.28 
 
 
828 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  29.33 
 
 
832 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.08 
 
 
240 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
358 aa  88.6  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  31 
 
 
411 aa  88.6  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
393 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 
833 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 
834 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
401 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
821 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.32 
 
 
393 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  31.78 
 
 
364 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  28.7 
 
 
820 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  31.96 
 
 
400 aa  86.3  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  28.19 
 
 
397 aa  85.9  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.07 
 
 
784 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.07 
 
 
784 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.07 
 
 
784 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.07 
 
 
784 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.07 
 
 
784 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  27.63 
 
 
827 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
336 aa  85.1  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.26 
 
 
784 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>