More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0148 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  89.32 
 
 
236 aa  437  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3978  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 
245 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5466  Nucleotidyl transferase  38.68 
 
 
241 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  34.08 
 
 
370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
361 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.07 
 
 
370 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  36.4 
 
 
361 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
367 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  35.96 
 
 
361 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
349 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
357 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  29.33 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
785 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
366 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2294  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2172  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  48.25 
 
 
843 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3290  WcbM  35.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3276  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0534  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  35.81 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1755  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  33.19 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.385636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  34.55 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3241  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  33.63 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
820 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  29.07 
 
 
238 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.29 
 
 
830 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  32.72 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.83 
 
 
784 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  30.26 
 
 
832 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.6 
 
 
784 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.6 
 
 
784 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.6 
 
 
784 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29.6 
 
 
784 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.83 
 
 
784 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.6 
 
 
784 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.6 
 
 
784 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.94 
 
 
392 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.6 
 
 
784 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
854 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.6 
 
 
784 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 
833 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  48.62 
 
 
828 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
227 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1422  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  33.04 
 
 
224 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
326 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
392 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3597  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
242 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
359 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  31.86 
 
 
832 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
832 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  29.73 
 
 
840 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
835 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
230 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  31.25 
 
 
359 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  27.93 
 
 
229 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
359 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  31.84 
 
 
228 aa  105  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.97 
 
 
356 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
841 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  33.66 
 
 
347 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.51 
 
 
400 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.84 
 
 
347 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
834 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
370 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  28.94 
 
 
818 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
237 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.38 
 
 
392 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.38 
 
 
392 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
810 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
816 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32 
 
 
364 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  26.17 
 
 
389 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  27.68 
 
 
836 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27 
 
 
392 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
364 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.81 
 
 
400 aa  101  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
365 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  25.96 
 
 
392 aa  101  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  26.34 
 
 
835 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
836 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  28.27 
 
 
842 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  27.43 
 
 
348 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  28.82 
 
 
841 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
843 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  25.81 
 
 
381 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  25.96 
 
 
392 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
359 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
230 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  26.03 
 
 
392 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
359 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 
359 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
351 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
392 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.09 
 
 
343 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1608  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  42.98 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>