More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1971 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 358 aa  698    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  74.65 
 
 		 359 aa  569  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  76.04 
 
 		 359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  73.89 
 
 		 360 aa  557  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  44.48 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  32.22 
 
 		 361 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  33.14 
 
 		 842 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.95 
 
 		 776 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.97 
 
 		 854 aa  185  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  30.86 
 
 		 827 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  35.69 
 
 		 828 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 840 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  32.37 
 
 		 843 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.69 
 
 		 833 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.49 
 
 		 784 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.73 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.49 
 
 		 784 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 785 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  36.83 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  34.08 
 
 		 832 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.79 
 
 		 842 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  31.81 
 
 		 816 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.51 
 
 		 828 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.87 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.81 
 
 		 841 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  32.51 
 
 		 820 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.39 
 
 		 842 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.4 
 
 		 784 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.26 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.4 
 
 		 784 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 		 827 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.57 
 
 		 784 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 784 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.57 
 
 		 784 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.57 
 
 		 784 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 818 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  33.9 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.42 
 
 		 712 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 828 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  35.07 
 
 		 359 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  32.25 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.38 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  32.7 
 
 		 834 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 843 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.3 
 
 		 784 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.56 
 
 		 837 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.85 
 
 		 784 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 		 818 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  30.33 
 
 		 833 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.89 
 
 		 810 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.46 
 
 		 841 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  31.37 
 
 		 820 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  31.36 
 
 		 830 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  30.87 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.28 
 
 		 832 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  32.07 
 
 		 821 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.27 
 
 		 830 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.21 
 
 		 832 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.3 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 		 835 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  28.92 
 
 		 835 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.77 
 
 		 836 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  28.85 
 
 		 836 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.19 
 
 		 828 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1877  nucleotidyl transferase  31.08 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  32.28 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.39 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 381 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  29.97 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.57 
 
 		 836 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.33 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.47 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30.56 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.59 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  34.83 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 835 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1037  nucleotidyl transferase  31.41 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000127553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  31.71 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  32.78 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  29.34 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  28.76 
 
 		 835 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.21 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  30.89 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 		 836 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.6 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  32.85 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>