More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1877 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1877  nucleotidyl transferase  100 
 
 
407 aa  817    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1037  nucleotidyl transferase  75.18 
 
 
409 aa  633  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000127553 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  72.73 
 
 
407 aa  629  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1307  nucleotidyl transferase  73.46 
 
 
413 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1967  Nucleotidyl transferase  49.88 
 
 
421 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.270118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1419  nucleotidyl transferase  47.88 
 
 
414 aa  382  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0198372  hitchhiker  0.00414302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0258  nucleotidyl transferase  31.92 
 
 
425 aa  195  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.402702  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
827 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
841 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  32.5 
 
 
833 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
835 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
828 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  32.34 
 
 
818 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.59 
 
 
836 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  31.5 
 
 
832 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
828 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.35 
 
 
836 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  29.45 
 
 
835 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 
835 aa  169  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  31.66 
 
 
843 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  29.34 
 
 
836 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  30.92 
 
 
843 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
827 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.66 
 
 
833 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.43 
 
 
820 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.78 
 
 
820 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.61 
 
 
392 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.35 
 
 
399 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
830 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
828 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.04 
 
 
842 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.14 
 
 
828 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  28.43 
 
 
370 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
810 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.86 
 
 
784 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.86 
 
 
784 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
818 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.56 
 
 
343 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  29.45 
 
 
836 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  28.15 
 
 
785 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
784 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  29.8 
 
 
840 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
842 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 
816 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
842 aa  153  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  31.89 
 
 
347 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.67 
 
 
834 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.75 
 
 
712 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.86 
 
 
784 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.43 
 
 
784 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
832 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.86 
 
 
784 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.36 
 
 
784 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.36 
 
 
784 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.36 
 
 
784 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  31.08 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.36 
 
 
784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
835 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.1 
 
 
832 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.43 
 
 
842 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.04 
 
 
776 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.14 
 
 
841 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.61 
 
 
837 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
347 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.9 
 
 
830 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
387 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
361 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  27.41 
 
 
370 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.23 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30 
 
 
361 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  27.79 
 
 
387 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28.96 
 
 
854 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  30.38 
 
 
380 aa  135  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  29.47 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  27.61 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
360 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  31.25 
 
 
359 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.6 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
366 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
821 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0557  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.54 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.920393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.83 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0909  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.7 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.751771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5027  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.59 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4760  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.59 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4598  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.59 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4620  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.59 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4709  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.34 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5122  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.59 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  28.42 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1455  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.83 
 
 
399 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3503  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.34 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5008  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.79 
 
 
367 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4979  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.79 
 
 
367 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.8 
 
 
389 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4998  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.53 
 
 
367 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0239  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.53 
 
 
367 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.440264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>