More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1037 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1037  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 409 aa  818    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000127553 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1877  nucleotidyl transferase  75.18 
 
 		 407 aa  633  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  72.73 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1307  nucleotidyl transferase  75.43 
 
 		 413 aa  619  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1967  Nucleotidyl transferase  50.12 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.270118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1419  nucleotidyl transferase  49.63 
 
 		 414 aa  385  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0198372  hitchhiker  0.00414302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0258  nucleotidyl transferase  30.83 
 
 		 425 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.402702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 		 818 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  34.07 
 
 		 833 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 835 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 830 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  33.5 
 
 		 828 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.16 
 
 		 842 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  30.58 
 
 		 827 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 		 835 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 836 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.7 
 
 		 836 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.98 
 
 		 836 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31 
 
 		 833 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  29.75 
 
 		 832 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  31.08 
 
 		 841 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 827 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.62 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30.83 
 
 		 834 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.46 
 
 		 828 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 810 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  28.86 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.9 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  28.36 
 
 		 820 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  30.3 
 
 		 843 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  30.58 
 
 		 843 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  29.57 
 
 		 836 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.03 
 
 		 784 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.03 
 
 		 784 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  30.52 
 
 		 835 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  27.49 
 
 		 835 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 828 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 842 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  30.86 
 
 		 816 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.37 
 
 		 842 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 842 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  30.1 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  28.75 
 
 		 818 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33 
 
 		 821 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  29.77 
 
 		 828 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.22 
 
 		 712 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.68 
 
 		 841 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.72 
 
 		 784 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30.85 
 
 		 830 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.94 
 
 		 832 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  30.35 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  30.52 
 
 		 832 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  27.5 
 
 		 776 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.02 
 
 		 837 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  30.34 
 
 		 840 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  27.61 
 
 		 784 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  31.54 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  27.54 
 
 		 784 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  27.54 
 
 		 784 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.54 
 
 		 784 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.54 
 
 		 784 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  28.71 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  27.38 
 
 		 784 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  29.9 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  31.41 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  27.38 
 
 		 784 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  27.46 
 
 		 785 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  28.08 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.42 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  28.23 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0724  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.43 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  30.69 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  27.14 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  28.87 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  26.6 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  30.32 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  30.92 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  30.92 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28.54 
 
 		 854 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.72 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3797  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.97 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0418315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  27.02 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.54 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.3 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.54 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.18 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0557  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  27.32 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.920393  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.37 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0946  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  29.44 
 
 		 416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.99 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0561  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  26.05 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.8 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  27.51 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  27.58 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  27.51 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  31.46 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.37 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  27.37 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>