More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1890 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  100 
 
 
357 aa  716    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  55.96 
 
 
361 aa  418  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  35.83 
 
 
364 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  34.34 
 
 
360 aa  196  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
358 aa  194  2e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  31.79 
 
 
362 aa  186  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  32.49 
 
 
367 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
359 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.20613 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.47 
 
 
364 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  30.05 
 
 
364 aa  167  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 
349 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  27.84 
 
 
820 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
370 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.1 
 
 
827 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  27.95 
 
 
830 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  28.61 
 
 
370 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30.62 
 
 
361 aa  152  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  30.3 
 
 
361 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  27.32 
 
 
834 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  27.03 
 
 
818 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.5 
 
 
837 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 
776 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  27.2 
 
 
840 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  27.3 
 
 
841 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  30.33 
 
 
366 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  29.7 
 
 
835 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  29.15 
 
 
357 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  27.7 
 
 
827 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  28.14 
 
 
832 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  26.24 
 
 
785 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  29.43 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.04 
 
 
828 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  27.12 
 
 
818 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  27.72 
 
 
841 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.1 
 
 
784 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  26.92 
 
 
833 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
361 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.27 
 
 
842 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.55 
 
 
784 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.29 
 
 
348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  27.37 
 
 
854 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  29.25 
 
 
363 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.55 
 
 
784 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  28.18 
 
 
830 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  29.89 
 
 
364 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  27.84 
 
 
833 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  25.75 
 
 
843 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  27.25 
 
 
370 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.27 
 
 
784 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.7 
 
 
836 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  29.27 
 
 
351 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.42 
 
 
828 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  30.06 
 
 
347 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.55 
 
 
784 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  27.7 
 
 
712 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.27 
 
 
784 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.27 
 
 
784 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  28.37 
 
 
835 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  25 
 
 
842 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.55 
 
 
784 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.49 
 
 
364 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  27.25 
 
 
370 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  25 
 
 
784 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  26.25 
 
 
832 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  26.04 
 
 
828 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
359 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
359 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
359 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  25 
 
 
784 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  29.66 
 
 
359 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
359 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  29.7 
 
 
347 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.61 
 
 
836 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  27.15 
 
 
828 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  26.18 
 
 
832 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  29.85 
 
 
359 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  25.9 
 
 
843 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
835 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  29.59 
 
 
835 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
810 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.53 
 
 
343 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
364 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.88 
 
 
842 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  27.81 
 
 
820 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
359 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  25.48 
 
 
842 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.78 
 
 
400 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  27.7 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.09 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  26.04 
 
 
836 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.67 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  27.6 
 
 
821 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  26.6 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  26.3 
 
 
816 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.08 
 
 
355 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 
357 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>