More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5001 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  93.39 
 
 		 243 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  73.14 
 
 		 243 aa  357  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  73.55 
 
 		 243 aa  354  6.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  73.33 
 
 		 243 aa  348  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  71.19 
 
 		 244 aa  345  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  72.73 
 
 		 243 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  59.67 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  33.61 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30.29 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  31.17 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  32.92 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  30.45 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  31.37 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  33.05 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.54 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.42 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  32.07 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.61 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  34.31 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  27.87 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  27.87 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  27.17 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  36.84 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  32.16 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  25.96 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.98 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  25.96 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  37.6 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  35.96 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.79 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  21.46 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.17 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.04 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  28.04 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  25.11 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  31.85 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  26.58 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  36.45 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  47.44 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  34.59 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.93 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.39 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.08 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  25.63 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  27.48 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  32 
 
 		 385 aa  58.9  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  31.05 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  32.28 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.41 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.93 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  29.27 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  27.08 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  30.94 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  30.16 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  35.8 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  28.1 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  33.96 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3750  Nucleotidyl transferase  31.52 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.03 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.94 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  30.54 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3692  nucleotidyl transferase  32.12 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.91 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  34.45 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  34.03 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  31.15 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  25.67 
 
 		 776 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.16 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.65 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  38.16 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  28.05 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.03 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  33.54 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  39.47 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  42.5 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.23 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0861  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  28.57 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.506105  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3833  Nucleotidyl transferase  30.91 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.863849  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  39.74 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.16 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  33.93 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>