More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0610 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  99.12 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  38.89 
 
 		 522 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  38.5 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.72 
 
 		 592 aa  143  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 590 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  36.41 
 
 		 596 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  34.26 
 
 		 595 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 611 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 		 589 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  32.43 
 
 		 619 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  30.14 
 
 		 300 aa  112  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 603 aa  98.2  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  34.44 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  40.54 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  55.41 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  36.89 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 		 630 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  52.7 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  39.36 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  51.35 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  38.61 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  36.45 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  32.48 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  47.3 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  50 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  52.7 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  26.53 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  52.7 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  35.03 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  51.35 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  51.35 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  38.46 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  36.63 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  31.21 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  38.54 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  48.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  45.95 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  44.59 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  35.35 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  36.19 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  40.54 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  40.71 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.76 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  32.99 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  35.79 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  52.73 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31.51 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  46.58 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  27.87 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  45.21 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  51.47 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  32.41 
 
 		 361 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  51.79 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 393 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  34.41 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  30.91 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.58 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  32.41 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  42.67 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  45.57 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  50 
 
 		 842 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  47.76 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.31 
 
 		 784 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  32.54 
 
 		 784 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  34.17 
 
 		 564 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.31 
 
 		 784 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  32.04 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  30.3 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  48.33 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  41.89 
 
 		 818 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  34.31 
 
 		 784 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  34.31 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.31 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.31 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  51.67 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  34.31 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  34.74 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  31.37 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  29.69 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  54.24 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  24.02 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.11 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  41.33 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  37.35 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  41.89 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>