270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1003 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 596 aa  1234    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  58.18 
 
 		 590 aa  714    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  57.43 
 
 		 595 aa  693    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  62.33 
 
 		 592 aa  792    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  53.95 
 
 		 619 aa  625  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  50.34 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  50.94 
 
 		 611 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  40.97 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  32.39 
 
 		 603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  25.04 
 
 		 622 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 622 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  32.42 
 
 		 300 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  36.41 
 
 		 227 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  35.94 
 
 		 227 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  29.8 
 
 		 304 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  27.6 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  28.89 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  24.05 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  24.9 
 
 		 383 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  37.86 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.93 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.67 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  27.83 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  27.13 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  32 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.9 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  26.88 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  25 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  30.58 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  31.01 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  29.36 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  35.42 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 616 aa  58.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  44.83 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  30.28 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  50 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  25.38 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.77 
 
 		 374 aa  57  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.29 
 
 		 400 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.55 
 
 		 241 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  28.95 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  24.59 
 
 		 307 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.52 
 
 		 400 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  23.13 
 
 		 313 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  43.33 
 
 		 248 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  36.47 
 
 		 249 aa  55.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  38.89 
 
 		 399 aa  55.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 384 aa  54.3  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  38.36 
 
 		 227 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  40.3 
 
 		 245 aa  53.9  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 393 aa  53.9  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  27.43 
 
 		 223 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  31.87 
 
 		 253 aa  53.9  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  38.6 
 
 		 247 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 232 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.64 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 254 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  26.9 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 230 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  24.91 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  31.87 
 
 		 253 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  25.28 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  24.91 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  38.36 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  25.5 
 
 		 307 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.94 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  27.34 
 
 		 341 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0634  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0970853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 263 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  41.07 
 
 		 229 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  41.07 
 
 		 229 aa  51.2  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  30 
 
 		 256 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  26.56 
 
 		 341 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2629  Nucleotidyl transferase  37.7 
 
 		 318 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.755027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 		 222 aa  50.8  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25.35 
 
 		 564 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1576  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  43.1 
 
 		 282 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  28.7 
 
 		 253 aa  50.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  34.74 
 
 		 243 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0493  UDP-glucose pyrophosphorylase  43.1 
 
 		 282 aa  50.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  25.66 
 
 		 222 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.32 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  27.14 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  29.29 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.13 
 
 		 545 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.25 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  36.67 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.03 
 
 		 254 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2547  Nucleotidyl transferase  37.7 
 
 		 313 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 591 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  23.84 
 
 		 311 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  42.31 
 
 		 246 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  36.11 
 
 		 237 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>