107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0608 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 622 aa  1252    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  98.39 
 
 		 622 aa  1236    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  34.46 
 
 		 304 aa  187  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  24.88 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  32.98 
 
 		 522 aa  171  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.99 
 
 		 592 aa  170  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  35.38 
 
 		 267 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.27 
 
 		 589 aa  160  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 616 aa  145  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  31.52 
 
 		 383 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.06 
 
 		 590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  31.16 
 
 		 383 aa  138  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.11 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  23.1 
 
 		 619 aa  136  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  27.08 
 
 		 595 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  29.2 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  29.04 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  27.44 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  28.79 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.69 
 
 		 603 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  27.34 
 
 		 311 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  27.44 
 
 		 311 aa  104  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  25.19 
 
 		 314 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.19 
 
 		 314 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  27.11 
 
 		 291 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  26.59 
 
 		 311 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  26.22 
 
 		 311 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  26.22 
 
 		 311 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  29.57 
 
 		 291 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  26.85 
 
 		 324 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  26.42 
 
 		 305 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  23.19 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  29.15 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  23.27 
 
 		 256 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  23.56 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.51 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  29.73 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  27.64 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  22.78 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  24.67 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  24.88 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  23.81 
 
 		 349 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 		 244 aa  60.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.14 
 
 		 223 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.43 
 
 		 241 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  31.03 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  25.48 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.21 
 
 		 232 aa  57  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 262 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  23.5 
 
 		 321 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 		 383 aa  54.3  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.61 
 
 		 253 aa  54.3  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  24.51 
 
 		 238 aa  53.5  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  23.43 
 
 		 237 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.65 
 
 		 564 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 		 630 aa  52.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  22.91 
 
 		 247 aa  52.4  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.08 
 
 		 253 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.24 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  33 
 
 		 374 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  25 
 
 		 249 aa  51.6  0.00004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  21.28 
 
 		 338 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.14 
 
 		 225 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  24.43 
 
 		 249 aa  51.2  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  25.15 
 
 		 247 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  29.91 
 
 		 219 aa  50.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 254 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  29.77 
 
 		 400 aa  50.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  21.55 
 
 		 238 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  23.65 
 
 		 317 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  42.59 
 
 		 255 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.32 
 
 		 561 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  29.66 
 
 		 219 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  21.76 
 
 		 254 aa  48.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.32 
 
 		 561 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.32 
 
 		 561 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  22.47 
 
 		 246 aa  48.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 192 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 		 326 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.32 
 
 		 561 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  22.44 
 
 		 326 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  25.86 
 
 		 561 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  25.9 
 
 		 224 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.16 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  22.84 
 
 		 326 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.85 
 
 		 545 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  21.48 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  25.59 
 
 		 243 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  23.24 
 
 		 256 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.21 
 
 		 562 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  21.65 
 
 		 353 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  20.83 
 
 		 263 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>