49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1457 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  100 
 
 		 314 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  98.73 
 
 		 314 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  55.99 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  55.99 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  55.66 
 
 		 311 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  53.72 
 
 		 307 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  49.84 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  47.9 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  48.88 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  47.25 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  32.2 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  31.3 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  25.56 
 
 		 622 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 622 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  25.59 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.25 
 
 		 383 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  28.89 
 
 		 595 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  31.42 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.64 
 
 		 611 aa  87  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  24.92 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  27.84 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 		 589 aa  79.7  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  29.59 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  25.75 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  26.59 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  25.28 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  27.09 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.94 
 
 		 590 aa  73.2  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.24 
 
 		 592 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  27.8 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  26.07 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  27.64 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  20.16 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  21.03 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.7 
 
 		 603 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  20.08 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  23.67 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  17.55 
 
 		 526 aa  45.8  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  20.08 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  18.25 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  31.33 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>