30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3530 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 338 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  29.79 
 
 		 255 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  26.79 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  25.84 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  34.83 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  26.2 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  21.37 
 
 		 622 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  23.68 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 622 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  26.7 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21.88 
 
 		 522 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4843  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4952  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4596  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4433  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4451  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4818  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4835  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.88 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.515713  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  24.66 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  27.09 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  22.98 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  22.78 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4813  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.33 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  26.77 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0423  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25.44 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4532  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0792  choline kinase  24.63 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000389702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3824  hypothetical protein  48.57 
 
 		 406 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372888  normal  0.874565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>